海上自卫队的新型神盾护卫舰「未来」号，参加美军在南太平洋所举办的共同演习。除了舰长梅津之外，舰上还有在防卫大学同期毕业的角松、菊池、小栗等 241名成员。顺利朝着夏威夷航行的「未来」号，在遭遇到一阵异常的风暴，被落雷击中而与友舰失去联络后，竟然出现在旧日本海军的联合舰队的中央。矗立于面前的舰影竟是日本史上最为人知的那艘战舰！而且其阵型正是1942年六月中途岛战役的排列方式。于是，船员们开始明白，「未来」号意外地由于时空次元的扭曲，他们现在所处之时正是60年前第二次世界大战中，日本与美国、世界为敌的中途岛海战战场！
在这个美日形势逆转的历史关键点，只要解放「60年后之兵器」的力量，就可以拯救日本人民，但是这将会介入历史而改变未来。「未来」号将会怎样抉择？……
原作是《沉默的舰队》、《革命情迷》的作者川口开治。川口开治的作品一向带有强烈的社会意识，对人类政治的演变一向有独到的见解。将发挥想象力于极致的预言，铺展出难以抵赖的现实意涵，和令人瞠目结舌的思想深度。也因此川口开治的漫画如此被人刮目相看，因为它的主题重量直逼纯文学。
川口在《ZTPANG次元舰队》第一册的扉页如此写道：‘日本人挑起了一场与美国和世界各国为敌的战争。这事一场倾全国之力投入杀戮的战争，现在回想起来，实在很难理解为什么会发生这么残酷的事，但对当时的人而言，这段残酷不堪的回首的历史却是他们曾经亲身度过的岁月。’，于是他自言这部作品的创作初衷：‘希望探讨这不同时代的人与人的鸿沟。’，这部作品应可看做以现代人的眼光，凝目、检视战争世代的人们的苦痛与执迷吧？
第1集 第1话
未来号出港海上自卫队的新型神盾护卫舰「未来」号，参加美军在南太平洋所举办的共同演习。除了舰长梅津之外，舰上还有在防卫大学同期毕业的角松、菊池、小栗等241名成员。顺利朝着夏威夷航行的「未来」号，遭遇到一阵异常的风暴。被落雷击中而与友舰失联的「未来」号，忽然出现在大舰队的中央。而矗立于正面的舰影，竟然是日本史上最为人知的那艘战舰......！
第2话
中途岛「未来」所遭遇的是旧日本海军的联合舰队。而且其阵型正是1942年六月中途岛战役的排列方式。第二天早上，美军轰炸机「无畏」朝着航空母舰「加贺」「苍龙」「赤城」进行俯冲攻击。如今「未来」降临在美日形势逆转的历史关键点。只要解放「60年后之兵器」的力量，就可以拯救日本人。然而这将会介入历史并且改变未来......「未来」的抉择将会是？
第3话
漂流者角松从漂流的水上侦查机中救出一名男子。这名男子自称是海军少佐．草加拓海。为了回到原来的时代，「未来」返回发生变异的坐标，然而入口却没有开启。「条件」和之前来的时候不一样......部份船员认为是因为应死的人居然活着，使得历史开始改变并丧失回到未来的条件，因此将矛头指向草加。而草加则是询问制止队员的角松：「你们是来自哪里的日本人？
第2集 第4话
未来的战斗克利斯．艾凡斯所指挥的美国海军潜水艇，朝着引擎熄火的「未来」发射鱼雷。「未来」在声纳室的声纳员确认鱼雷声之后，紧急启动引擎展开回避行动．鱼雷逐渐逼近所造成的恐怖，使得水雷长米仓朝着美国海军潜水艇发射反潜火箭…
第5话
草加的选择迎击美国海军潜水艇的「未来」。见证整场战斗的草加，被角松带进了资料室。原子弹投掷、无条件投降……日本直到21世纪的历史，为草加带来了哪些启示？隔天早上，为了准备进入横须贺港，警戒用直升机「海鸟」前往小笠原进行侦查。在海鸟号降低高度时，背后出现了两架日本海军军机。面对贯彻专守防卫理念的海鸟号，高挂日本国徽的战斗机毫不留情露出了獠牙。
第6话
攻击命令 森二尉中弹－－。面对佐竹一尉沈痛的开火要求，角松的内心不断挣扎着。同是日本人也非得要流血吗？在哀悼森的礼炮声中，角松述说着专守防卫的理念，然而队员们却开始有所异议。在舰艇目的尚未明确的状况下，「未来」朝着南方前进以补给燃料。舰艇停泊在安那巴斯群岛，角松则与提议本次作战的草加，一同来到了昭和17年的新加坡。
第3集 第7话
马来铁道角松与草加搭乘穿越丛林的马来火车至昭南市。中途睡着的角松在醒来后，不仅草加失?了，竟还遇到宪兵的临检。虽然在遭宪兵盘问时，草加及时出现解危，但角松却因这个意外而内心有所动摇。在使用伪造文件完成作战之后，带着角松参加宴会的草加，被一个意外的人物认了出来。依照未来资料室里所看到的战史中，这个人根本不应该出现在新加坡…
第8话
追踪者囤积大量物资的油轮，以及停泊于安那巴斯群岛沿岸的可疑战舰…津田的推理连成一线了。津田与其手下的特务人员，与「东进丸」的船员调包，并且拘禁了草加及角松。知道「未来」存在的津田询问战争的结果，草加的回答则是「我们将会改变历史」。面对情绪激昂的角松，津田表示将会强制拘捕「未来」。被逼上绝路的角松，对津田打出了最后一张王牌。
第9话
生死线同意草加所提出的条件之后，角松带着津田返回「未来」。角松将他在陆地上看到的一切都告知了梅津舰长。他所见到的并非只是历史的记录，而是看到活在这残酷时代的人们…。查觉到21世纪似乎正在改变，再加上没有归宿及目标的长期漂流，使得队员们都感受到了极限。既然如此…「未来」开始朝着瓜达康纳尔群岛前进。这是这艘战舰第一次自己选择该走的路。
第4集 第10话
交流想要知道这个时代的人们在想些什么，因此尾栗走上了东进丸。他对众人表示自己来自60年后，因此河本兵曹长询问他日本是否可能遭受空袭。面对家人住在广岛的河本，尾栗给他的答案是…?希望尽可能减少这场战争的牺牲者，未来」所订的目标就是要阻止瓜达康纳尔岛攻防战。
第11话
瓜达康纳尔岛佐竹所驾驶的「海鸟」，载着草加强行登陆战舰「大和」，并且与山本五十六会面。草加对山本提出关于攻略瓜达康纳尔的建议。而在另一方面，角松与尾栗、柳一同登陆瓜达康纳尔岛东北方的奥斯汀山中。
第12话
射手座之箭瓜岛当天的战斗依照史实进展着。美国海军陆战队登陆，三川舰队袭击支援登陆的美澳舰队而大获全胜，之后三川舰队并未攻击美国运输船队便撤退。「草加什么都没做吗？！」再这样下去，运输船队将完成对美国陆战队的补给，如此一来就无法避免美日在瓜岛的攻防战陷入胶着!?
第5集 第13话
黄金之国为了让留在瓜达康纳尔岛上的美军陆战队，能够不流一滴血全部撤退，「未来」放出射手座之箭－－鱼叉飞弹予以警告。然而在同一时刻，「大和」所率领的攻击部队接近瓜岛，目的是要歼灭登陆的美军陆战队第一师团。来自「大和」催促角松等人从瓜岛撤退的通讯，等于是宣告了草加的背叛。
第14话
激烈冲突！不是大日本帝国，也不是败战之后的日本，而是建立全新的国度「日邦格」，这就是草加的野心。为了实现「值得夸耀的谈和」，草加表示必须歼灭美军陆战队，而角松警告如果不停止攻击，将会以对舰飞弹攻击「大和」。草加问角松「身为指挥官的你，现在冷静吗？」，听到答案之后就忽然切断了通讯。
第15话
生者与死者「大和」朝着美军陆战队发射的主炮，全部都被「未来」击坠了。在「大和」舰上，参谋们主张不应该屈服于「未来」的恫吓，而草加则是建议停止作战。山本五十六的回答将是……？而在另一方面，位于瓜岛的角松等人，被正在搜索日军的美军发现，为了保护自己的生命，不得已朝着美军开枪射击。
第6集 第16话
冈村少佐的意志拯救在史实上应该全灭的瓜岛工兵队。2500名队员中，只有185人来到海岸。角松将上船作业交给津田之后进入密林，并且遇见工兵队的冈村少佐。他仍然留在密林里寻找失踪的队员们。依照史实，冈村将与一周后前来的瓜岛进攻部队并肩作战，并且在最后生还。
第17话
日邦格胎动为了收容草加等人，「未来」进入了联合舰队的根据地特鲁克。梅津舰长与山本长官见面，并且述说着今后的历史。山本在陆军的彻底交战派代表－－过政信的压力下，被逼迫继续协助瓜岛登陆计划，为了尽早与各国谈和，山本希望梅津能让出「未来」的指挥权……。
第18话
再会山本长官的反对终究徒劳无功瓜岛作战依照原订计划进行。由冈村少佐所率领的工兵队…将与历史相同和一木分队并肩作战。登陆特鲁克的角松在偶然间发现草加。追着他到最后所看到的，是正准备要起飞的陆军飞机……！
第7集 第19话
另一个参谋本部「未来」即将返回横须贺。然而在瓜岛决战的关键时刻，不能将驱逐舰挪为护卫之用，联合舰队司令部因而意见分歧。此时泷少佐提议由潜舰护卫，同时自己也一起为未来护航。将「未来」视为灾难源头的泷，心中究竟在想些什么?回到日本的草加与石原莞尔见面，提供能够颠覆目前美日利害关系的情报。这个时候，美国航空母舰「胡蜂号」召集了哈顿中校率领的轰炸飞行队。
第20话
伊．21号与伊21号潜舰共同返回横须贺的「未来」，在雷达上捕捉到尚未确认的飞机影子。伊号的回答是「日本军机」。有所怀疑的角松与柳一起进入伊号。击沈「未来」－这就是泷的答案。伊号急速下潜，被留在海面上的未来，眼前出现了美军40架战机的大型编队…！判断留在伊号的角松等人应该安全，因此未来选择离开作战海域，然而伊号却以每分2m的速度再度上浮！
第21话
1对40遭受到第六轰炸飞行队攻击的未来，如果使用自动发射管制模式，就可以在一瞬间击坠整个编队。然而菊池选择只打倒部份战机，藉以重创敌方的战意，因此只发射主炮及6发海麻雀飞弹。战斗开始之后仅一分钟，飞行队便丧失半数的战机，然而残存的部队毫不退缩，哈顿的座机从上空对「未来」发动突击…！船舰损伤，队员牺牲了生命…。面对准备进行第二次攻击的胡蜂号，菊池所做出的决定是？！
第8集 第22话
警告击沈「胡蜂号」……这是菊池的痛苦抉择。站在不同立场的全都是「敌人」，如果无法承认这一点，就无法保护自己－－。「未来」朝着「胡蜂号」发射出战斧飞弹。角松藉由伊号的潜望镜，得知了海上所发生的事态。射向天空的战斧飞弹，以及受创冒烟的「未来」……。角松回顾菊池当年的想法。菊池在即将从防卫大学毕业之前，曾经一度拒绝晋升任官。
第23话
胡蜂号击沈无视于「未来」警告的「胡蜂号」被战斧飞弹击中，一万五千吨的空母在三十分钟之内沉没。在伊号潜舰中，泷宣布要以鱼雷攻击「未来」。即使「未来」拥有压倒性的战力，面对从近距离一齐发射的鱼雷，也不可能完好无伤……无视于柳的担心，角松断言这是不可能的。角松要柳说出「无法发射鱼雷的理由」，柳也连忙说出了某个答案。伊号潜舰的岛本舰长，在听到这个答案之后将会……？！
第24话
死者与生者一木分队第二梯团放弃登陆瓜岛。冈村对过参谋说出他从「来自未来的人」那儿听到的瓜岛攻防战结果。日军惨败，两万五千名官兵因疾病及饥饿而死－－面对打算自杀的过参谋，冈村会采取什么行动？！「未来」将「胡蜂号」击沈之后，对于双方的乘员都造成冲击。哈顿面临第六轰炸队瓦解，已经好友死去的惨剧。「未来」也必须面对「五人丧生」的现实。目睹到战争的沉重，有所觉悟的队员们将会……。
第9集 第25话
返航帝国海军对进入横须贺港的「未来」严加戒备。面对前来交涉的海军后备上将米内光政，梅津要求他能够确保「未来」的生存权。相对于希望减少战争牺牲者的梅津，米内是这么说的：「希望贵舰能在这横须贺的船坞中，就这样逐渐老朽化为锈铁。」此时的草加要津田前来横滨的某间饭店，告诉他这半年将会是早期谈和的最后机会－－。就这样草加从日本出发，踏出前往理想国度「日邦格」的第一步。
第26话
归宿获准登陆横须贺之后，角松下船前往东京深川。他在这个父亲洋一郎的老家所遇见的家具师父，正是角松的祖父洋吉。向洋吉打听洋一郎去向的结果，得知洋一郎在三天前车祸丧生。这个世界与自己所在的日本连不起来……！改变历史的是草加，让他活下来的责任在于自己。因此角松继续寻找草加，在不得已被纳入联合舰队指挥的「未来」中，留下了最后的意志－－。